Este topónimo donostiarra solo cuenta con un testimonio, de mediado el siglo XIX, tomado del trabajo Donostiako toponimia: Ysabelcho (1841, casa, D.U.A.-B-10-II-362-2).
En el topónimo hay un único elemento, el antropónimo Isabeltxo, que es un hipocorístico, formado por el antropónimo Isabel al que se ha añadido el sufijo diminutivo -txo. También aparece en el libro de P. Salaberri Izen ttipiak euskaraz, p. 215:
Isabeltxo, Ixabeltxo (Isabel, Ixabel): Ixábeltxò (Lei.); Goizuetako Isabelchonea etxe izenean Isabeltxo dago (XIX. m., Her., 1978: 78).El antropónimo Isabel fue bastante conocido en la capital guipuzcoana ya que en la misma ciudad está el topónimo Isabeletxe, formado por Isabel y etxe 'casa'.
